Lille flagspætte er udbredt over størstedelen af Europa fra det nordlige Skandinavien til Middelhavet og østpå gennem det centrale Asien til Stillehavet. Arten begyndte at yngle i Danmark i 1964, og bestanden vurderedes i 1990erne til 70-100 par. Den lille flagspætte er hovedsagelig standfugl, skønt der i visse år foregår mindre invasioner. I Danmark ses i nogle år et mindre antal træk- og vintergæster.
Læs mere om arten i afsnittet fra Dansk Trækfugleatlasher